Финансовый комитет анализирует годовую смету РФС, отчет об ее исполнении, а так же годовую бухгалтерскую отчетность РФС, и предоставляет их в Исполком (Бюро Исполкома) для утверждения.

Комитет по безопасности и работе с болельщиками курирует вопросы безопасности проведения спортивных мероприятий и работы с болельщиками, консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, а так же представляет в Исполком (Бюро Исполкома) предложения по усовершенствованию мер безопасности при проведении спортивных мероприятий.

Комитет массового футбола курирует вопросы развития и пропаганды массового футбола, в том числе детско-юношеского, студенческого, любительского (непрофессионального) футбола, футбола среди лиц с ограниченными возможностями здоровья, а так же разновидностей футбола и его спортивных дисциплин; проведения массовых соревнований, в том числе соревнований по футболу среди детско-юношеских, студенческих, любительских (непрофессиональных) команд, среди лиц с ограниченными возможностями здоровья, соревнований по разновидностям футбола и его спортивным дисциплинам; консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, разрабатывает и представляет в Исполком на утверждение структуру массовых соревнований, а так же положения (регламенты) о таких соревнованиях и их календари.

Комитет программ развития футбола курирует вопросы разработки программ развития футбола в России, содействует региональным футбольным федерациям в разработке региональных программ развития футбола; консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, разрабатывает и представляет в Исполком на рассмотрение/утверждение программы развития футбола (его разновидностей).

Основные цели работы Комитета – развитие судейства и инспектирования, объединение и координация межрегиональных судейских организаций для содействия и реализации федеральных и региональных программ по развитию судейства и инспектирования соревнований по футболу под эгидой РФС. Поиск, обучение, подготовка, воспитание футбольных судей и инспекторов, проводящих соревнования различного уровня. Обобщение отечественного и зарубежного опыта в целях улучшения качества судейства и инспектирования соревнований, подготовки футбольных арбитров, координация деятельности межрегиональных и региональных судейско-инспекторских организаций, развитие связей и международного сотрудничества с судейскими организациями других стран, разработка документов, необходимых для обеспечения защиты прав и интересов судей и инспекторов.

Комитет женского футбола курирует вопросы развития женского футбола, проведения соревнований по футболу среди женщин, консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, разрабатывает и представляет в Исполком на утверждение структуру соревнований по футболу среди женщин, а так же положения (регламенты) о таких соревнованиях и их календари.

Комитет пляжного футбола курирует вопросы развития пляжного футбола, проведения соревнований по пляжному футболу, консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, разрабатывает и представляет в Исполком на утверждение структуру соревнований по пляжному футболу, а так же положения (регламенты) о таких соревнованиях и их календари.

Технический комитет курирует вопросы научно-методической деятельности в области футбола, присвоения спортивных званий и почётных спортивных званий и консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по указанным вопросам, осуществляет анализ выступления сборных команд Российской Федерации по футболу, разрабатывает и представляет в Исполком на утверждение научно-методическую документацию, в том числе связанную с подготовкой  футболистов и обучением тренеров, а так же представляет в Исполком (Бюро Исполкома) на утверждение списки лучших футболистов по итогам спортивного сезона.

Юридический комитет курирует правовые вопросы в области футбола и консультирует Исполком (Бюро Исполкома) по таким вопросам, представляет в Исполком предложения по усовершенствованию Устава, регламентов и иных документов РФС, а так же по поручению Исполкома осуществляет правовой анализ документов, представляемых в Исполком (Бюро Исполкома) на утверждение.

Медицинский комитет курирует вопросы спортивной медицины, антидопингового контроля в области футбола, вносит в Исполком предложения по усовершенствованию системы антидопингового контроля и разрабатывает соответствующие документы, а так же разрабатывает методики снижения травматизма в футболе.

Комитет ветеранов футбола курирует вопросы взаимоотношений РФС с ветеранами футбола и их поддержки, а так же вопросы проведения соревнований среди ветеранов футбола, курирует вопросы сбора, оценки и подготовки материалов по назначению персональных стипендий РФС ветеранам футбола. 

1. Александр Багратович Мирзоян (председатель Комитета)

2. Геннадий Васильевич Ефанов (заместитель председателя)

3. Александр Валентинович Иванов (заместитель председателя)

4. Владимир Алексеевич Пономарев

5. Александр Валерьевич Орлов

6. Эрнест Эдуардович Маркаров

7. Рим Раифович Камалов

8. Аркадий Семенович Генсон

9. Владимир Георгиевич Кочегаров

10. Евгений Юрьевич Милешкин

11. Юрий Михайлович Федотов

12. Анатолий Алексеевич Зинченко

13. Александр Васильевич Плошник

Комитет по развитию региональных центров спортивной подготовки курирует вопросы создания и развития региональных центров подготовки футболистов, осуществляет проверку претендентов на соответствие установленным требованиям для получения статуса «Региональный центр подготовки футболистов» и представляет результаты проверки в Исполком, осуществляет контроль за деятельностью региональных центров подготовки, разрабатывает документы, регламентирующие деятельность региональных центров подготовки и порядок получения такого статуса.

Комиссия по персональным стипендиям курирует вопросы сбора, оценки и подготовки материалов по назначению персональных стипендий РФС ветеранам футбола или иным лицам, согласно утверждаемым Исполкомом или Бюро Исполкома регламентирующим документам.

Комитет по тренерским квалификациям курирует вопросы квалификации тренеров команд, участвующих в соревнованиях по футболу под эгидой РФС, аттестации тренеров, а так же разрабатывает и представляет в Исполком на утверждение  документы, регламентирующие порядок проведения аттестации тренеров.

Комиссия является контрольно-ревизионным органом, осуществляющим внутренний контроль за финансово-хозяйственной деятельностью РФС.